Απώτερος στόχος της Ευρωπαϊκής Ένωσης Υγείας είναι η ενδυνάμωση των Συστημάτων Υγείας των κρατών-μελών δίνοντας έμφαση στην ισότητα και τη συνοχή και η αποτροπή μελλοντικών υγειονομικών κρίσεων, όπως αυτή που προκάλεσε η πανδημία Covid-19